Dizinin fragmanlarının ekranda yayımlanmaya başladığı 11 Aralık'tan, 6 Ocak akşamına kadar bütün program türlerinde gelen şikayetlerin yüzde 93'ü "Muhteşem Yüzyıl" ile ilgili oldu. Samsun'da da diziye olan tepkiler dinmiyor. "Muhteşem Yüzyıl" dizisi hakkında bildiri yayımlayan Memur-Sen Samsun İl Başkanlığı, Has Parti Samsun İl Başkanlığı, milletvekilleri ve çeşitli sivil toplum örgütleri bu diziyi tarihe hakaret etmekle suçluyorlar.